每月初,创腾科技生命科学模拟技术部都会通过微信公众号定期总结BIOVIA Discovery Studio 用户在软件使用过程中产生的一些具有代表性的问题。基于我们的工程师团队在分子模拟领域内十多年的经验,定期为大家带来实实在在的技术干货分享。
BIOVIA
Discovery Studio
三月
Q&A
Q1
DS对接后怎么计算受体-配体结合能?
计算对接后受体-配体的结合能可以使用下面的工具:输入要计算的受体结构和配体结构,
进行计算,得到binding energy
Q2
DS中大分子对接后相互作用能怎么计算?
得到对接后的复合物,分析出相互作用面上的氨基酸,添加好力场,参考下图找到相应的计算工具:
计算后得出总的相互作用能,每个氨基酸的贡献的相互作用能及分项能量。